古代文明研究中心下设秘书处，由巩文任秘书长，中心设秘书若干名，负责中心的日常事务和对外联系。秘书处设在中国社会科学院考古研究所。

    秘书处成员：

    巩文　丛德新　宫长为　缪雅娟　徐良高　刘国祥　王小庆　辛爱罡